Primeiro de tudo, aconselhava-te a experimentar o Linux. Só por ser diferente, não quer dizer que seja um bicho papão. Se não gostares da distro, isso é outra história, instalas outra por cima. Mas era bom veres o que o Linux tem para oferecer. Continuando...
O Windows e o Linux estão instalados em Dual-Boot. Cada um usa a memória completa, pois ao um estar iniciado, o outro não está activo, não está a gastar memória.
Para saíres do Windows e iniciares o Linux (por exemplo) tens que encerrar o computador, para que o Windows liberte a memória, e possas iniciar o Linux, com a memória completa, e não limitada. Os dois não estão a consumir memória ao mesmo tempo.
Relativamente à tua dúvida... Isso não vai resolver o teu problema. O Windows é o Windows, não é por tirares o Linux, um sistema à parte, que não está a interferir nada no Windows, que os problemas vão desaparecer. É uma ideia errada que as pessoas em geral têm, de dois ou mais sistemas instalados dar problemas.
Mesmo tirando o Linux, os problemas do Windows continuarão. Mas se queres tanto, aí vai:
1. Faz download de um Linux Live-CD, como o do Ubuntu.
2. Inicia o live-cd.
Agora aqui vai uma dúvida. Dependendo da resposta, segues um diferente passo. Um apenas apaga a partição do Linux, e outro apaga as duas, para que possas fazer uma clean install do Windows, que é sempre melhor que uma reparação. Tens que ver se a pen faz clean install ou se apenas repara a instalação do Windows. Recomendo o passo 3/2 se a tua pen dá para clean install. Se não, segue o outro.
3/1. Após estares no ambiente do Linux Live-CD que escolheste, vais à gestão de disco, e apagas a(s) partições que o formato não é NTFS. Mete o espaço livre na partição NTFS.
3/2. Após estares no ambiente do Linux Live-CD que escolheste, vais à gestão de disco, e apagas todas as partições.
E pronto... Aconselhava-te a ficares como estás, ou se não gostas do Linux, experimentar mudar de distro... Mas nunca ficar só com o Windows, porque isso até nem te ia resolver o teu problema. A ideia que tens que os dois estão a consumir memória ao mesmo tempo é errada. A única coisa que notas é a lentidão do Windows.
Cumprs.